180 тестов за шесть часов: КФУ и «Русфонд» объединились в борьбе с коронавирусом

Два месяца в особом режиме и тесты на COVID-19 для более 5 тысяч человек — так работала NGS-лаборатория в Казани, помогая врачам Татарстана бороться с коронавирусом. Лаборатория, созданная «Русфондом» и Институтом фундаментальной медицины и биологии Казанского федерального университета (КФУ), расположена в одном здании с Университетской клиникой. Несмотря на то, что сама клиника не попала в число «ковидных» больниц, нагрузка на учреждение в период пандемии резко увеличилась.

Этот крупный многопрофильный стационар на 840 коек обслуживает как саму Казань, так и часть районов Татарстана. На его базе действуют хирургическое и терапевтическое отделения, сосудистый центр, роддом, а также поликлиника. Плановое лечение в клинике приостановили, однако неотложных больных было много. Круглосуточно поступают люди с инфарктами, инсультами, тромбозами, которые являются в том числе и осложнениями COVID-19. Поэтому специалисты должны проверять всех пациентов на новый коронавирус, чтобы направлять его носителей в профильные учреждения для оказания помощи, — до 100 новых больных в день.

Если у пациента, находившегося в медучреждении, впоследствии выявляют коронавирусную инфекцию, за всеми врачами, которые с ним контактировали, устанавливается обязательное наблюдение. Также необходимо регулярно тестировать медсестер и санитаров клиники, а еще примерно 800 работников самого Казанского федерального университета. На тот период собственных технических мощностей клинике оказалось недостаточно. Поэтому медики университета обратились за помощью к президенту «Русфонда» Льву Амбиндеру.

В связи с пандемией «Русфонд» и Национальный регистр доноров костного мозга имени Васи Перевощикова (Национальный РДКМ) временно приостановили массовые донорские акции. Высокотехнологичное оборудование NGS-лаборатории не использовалось для его непосредственных целей. А часть медицинской техники, которая применяется при типировании потенциальных доноров костного мозга, можно было использовать для анализов на коронавирус, например, амплификаторы. Так что по решению президента «Русфонда» Льва Амбиндера с апреля лабораторию задействовали для диагностики врачей, медицинского персонала и пациентов Университетской клиники на COVID-19.

Тестирование проводили две команды: группа врачей из Университетской клиники и группа научных работников из Института фундаментальной медицины и биологии КФУ.

Всего за период работы с использованием мощностей лаборатории фонда были выполнены тесты для более 5 тысяч человек.

Отметим, поскольку лаборатория не клиническая, а научно-исследовательская, все положительные тесты впоследствии перепроверялись в республиканском Роспотребнадзоре — результаты подтверждались практически в 100% случаев.

За этот непростой период университет сумел переоборудовать и подготовить собственную больничную лабораторию под нужды исследований на COVID-19. Потому с 15 июня NGS-лаборатория вернулась к своей обычной работе — типированию образцов крови потенциальных доноров костного мозга.

По словам заведующей лабораторией «Русфонда» и Казанского (Приволжского) федерального университета (КФУ) Елены Шагимардановой, в период пика эпидемии сотрудники лаборатории продолжали выполнять свои обязанности.

«Сначала у нас был большой запас исследований, по которым «мокрая» часть работы уже сделана. И мы в удаленном режиме обрабатывали данные секвенирования, — рассказывает Елена Шагимарданова. — В остальное время занимались наукой. Дело в том, что в процессе работы с генами, отвечающими за тканевую совместимость, удалось выявить аллели (вариации генов), ранее не описанные учеными. Их надо было зарегистрировать в международной базе. Без такой регистрации носителям этих аллелей просто не смогут в случае необходимости найти генетического близнеца. А сами они не смогут стать донорами для кого‑то другого».

За время эпидемии сотрудники лаборатории отправили в международную базу данные о 20 новых аллелях — часть из них уже зарегистрирована, часть еще находится на проверке.